Norovirus: Détection simple pour l’épidémiologie complexe

Dans les années qui ont suivi, d’immenses progrès ont été réalisés dans la technologie des anticorps monoclonaux et la détection des acides nucléiques, [.] Compte tenu de toutes les avancées diagnostiques des dernières décennies, il est à la fois remarquable et un peu triste que les critères de Kaplan et al restent un outil si pertinent pour reconnaître les épidémies provoquées par norovirusTurcios et al ont confirmé, sur un ensemble de données beaucoup plus large et varié que Kaplan et al avaient à leur disposition, ce que ces chercheurs suggéraient à l’origine. spécifique -% – et raisonnablement sensible -% – pour différencier les foyers causés par les norovirus et ceux provoqués par les bactéries Identifier l’agent étiologique dans une infection sporadique avec une maladie si commune et typiquement bénigne est presque impossible, donc les algorithmes diagnostiques sont optimisés pour les épidémies. un « diagnostic » avec une sensibilité connue permet de nombreuses applications épidémiologiques pratiques Par exemple, si l’on dispose d’un ensemble de données de gastroint staliniennes, typiques de nombreux laboratoires nationaux, on pourrait analyser les données pour voir combien de ces foyers correspondent aux critères de Kaplan et al Une proportion donnée Proportionobserved correspond aux critères Et pour corriger les résultats faux-positifs et faux-négatifs qui sont mal classés, la formule suivante peut être utilisée pour estimer la vraie proportion Proportiontrue d’épidémies causées par norovirus en fait, ce n’est rien de plus qu’une formalisation de l’approche utilisée par Turcios et al : Proportiontrue = [Proportionobserved – – Spécificité] / [Sensibilité – – Spécificité] Bien sûr, la grande limite de ce genre d’extrapolation est l’hypothèse implicite que les données représentent une sélection aléatoire de l’occurrence globale des épidémies, ce qui n’est clairement pas le cas pour les données des Centers for Disease Contrôle et prévention utilisés par Turcios et al Ces données proviennent d’épidémies d’origine alimentaire De telles éclosions ont tendance à être importantes mais de courte durée, car elles Les aliments contaminés fournissent un mécanisme permettant de délivrer un inoculum massif, de sorte que la manifestation d’une maladie d’origine alimentaire peut différer de celle d’une infection transmise d’une personne à une autre http://suhagra4ed.com. En outre, les épidémies d’origine alimentaire sont généralement causées par divers génotypes de norovirus. La niche moléculaire dans les institutions est dominée par un seul virus connu sous le nom de génotype génogroupe II ; Ce phénomène n’est vraiment pas compris En fait, il manque beaucoup d’informations de base sur les norovirus dans la communauté, qui résultent en partie d’une surveillance biaisée. Quelle est la fréquence des petites épidémies Quelle est l’importance relative de la propagation alimentaire et individuelle dans la maintenance? Pourquoi l’épidémiologie des norovirus entre l’Europe du Nord – où les hôpitaux font régulièrement l’expérience d’énormes foyers de norovirus – et le reste du monde développé diffèrent-ils si fortement? Et peut-être le plus important, quel est le rôle des norovirus dans cette énorme fraction non diagnostiquée Les norovirus ne reçoivent pas le respect que les norovirologistes pensent mériter Bien que ces virus causent une charge substantielle de maladies d’origine alimentaire à l’échelle internationale , seul un pourcentage du personnel de santé publique américain les classe parmi les meilleurs agents [ ] Et, malgré les données, peut-être, d’une certaine manière, ils ont raison. Les approches analytiques En temps réel, les professionnels de santé publique évaluent la fréquence à laquelle un problème se présente et la probabilité que leurs efforts aient un impact positif en termes de morbidité et de mortalité. Leurs évaluations sont susceptibles d’être non linéaires et, peut-être sans le savoir , ils appliquent un calcul mental sophistiqué sur le risque d’hospitalisation ou de décès dans l’éclosion, l’efficacité de l’intervention équilibrée avec d’autres priorités de la maladie, et la possibilité d’être impliqué dans une enquête nocturne et l’infection du Daily Daily Etant donné que les virus ne peuvent pas être cultivés, la collecte de preuves concluantes de l’efficacité des mesures de contrôle est restée insaisissable. Malgré la forte incidence de ces infections, la perception du public et de la communauté L’importance des norovirus peut être tout à fait rationnelle. Cependant, des études soigneusement conçues, plutôt qu’une analyse ad hoc des données existantes, remettent systématiquement en question de nombreuses hypothèses sur l’épidémiologie des norovirus La maladie, au moins dans certaines populations, peut être plus sévère que nous le pensions autrefois ; la durée de l’excrétion est étonnamment longue ; facteurs génétiques innées immunité modérée ; L’impact économique de cette maladie «bénigne» est énorme. Nous avons donc besoin d’études prospectives, véritablement intégrées, qui lancent une surveillance sensible, utilisent des tests de diagnostic modernes et la caractérisation moléculaire, et apprécient l’épidémiologie complexe plutôt que de la négliger. des norovirus

Remerciements

Je remercie Bob Adak, David Brown, Manoj Gambhir et Leah Garcés pour leur lecture attentive et leurs commentaires utiles. Conflits d’intérêts potentiels BL: no conflicts