Dans la littérature

Comprendre Klebsiella pneumoniae

Brisse S, Fevre C, Passet V, et al Clones virulents de Klebsiella pneumoniae: scénario d’identification et d’évolution basé sur la caractérisation génomique et phénotypique PLoS One; : eK pneumoniae est un pathogène humain fréquemment rencontré qui a attiré beaucoup d’attention depuis son acquisition des β-lactamases à spectre étendu et plus récemment des carbapénémases, ainsi que l’apparition de souches hypermucoïdes associées aux abcès hépatiques pyogènes et à l’endophtalmie endogène. La virulence et le type clinique d’infection provoqués par les souches de K pneumoniae ont traditionnellement été associés à son sérotype capsulaire. Parmi les K capsulaires de l’organisme, K, K, K et K ont été associés à des infections virulentes, K étant particulièrement associé à une pneumonie et un abcès hépatique pyogénique K, K et K sont associés à une pneumonie acquise dans la communauté, alors que tous les isolats qui causent le rhinosclérome causée par K pneumoniae subsp rhinoscleromatis sont K, et ceux qui causent la rhinite atrophique causée par K pneumoniae subsp ozonae sont principalement K et rarement KDespite ces associations, l’importance relative de la virulence déterminée par le clonage et l’expression des facteurs de virulence, qui peuvent être transférés horizontalement à travers les clones, est inconnue. Si le type K caractérise pleinement les clones virulents, le typage capsulaire peut fournir suffisamment d’informations sur un isolat pour permettre sa compréhension de sa virulence et de son potentiel écologique. Brisse et ses collègues ont largement caractérisé des isolats d’origines environnementales et cliniques diverses par des méthodes génomiques et phénotypiques afin de mieux comprendre la structure phylogénétique de l’espèce et, en particulier, l’association de la virulence avec des facteurs génétiques et génétiques. autres caractères phénotypiquesL’analyse phonétique des gènes ménagers a permis d’identifier des clones distincts qui se distinguent par des caractéristiques biologiques et des syndromes cliniques. Ces clones appartiennent au type capsulaire K fortement associé à des infections particulières: clone CCK associé à un abcès hépatique pyogène; et clone CCK, qui était associé à une pneumonie K pneumoniae subsp rhinoscleromatis et K pneumoniae subsp ozonae correspondait à un clone monomorphique dérivé de K pneumoniae Il n’y avait pas une association stricte de types capsulaires individuels avec la virulence ou avec des clones individuels comme conséquence du transfert horizontal L’examen de la diversité métabolique, tel que déterminé par la capacité à utiliser une gamme de sucres, indique que chacun de ces organismes a suivi une voie évolutive menant à la spécialisation dans des niches écologiques individuelles, avec K pneumoniae subsp rhinoscleromatis adapté à un mode de vie intracellulaire dans les cellules épithéliales nasales et K pneumoniae subsp ozonae adapté à la surface de ces cellules K clone pneumoniae CCK, associée à l’abcès du foie pyogène, contrairement à ces organismes, conserve la polyvalence métabolique – une constatation compatible avec l’acquisition récente de son caractère de virulence particulière Cette étude a amélioré notre compréhension de K pneumoniae Il a maintenant été démontré que le recours au typage capsulaire était moins pertinent pour définir les souches de l’organisme et leur potentiel de virulence. Les découvertes décrites par Brisse et ses collègues servent à ouvrir une porte à des investigations moléculaires, cliniques et épidémiologiques supplémentaires, qui conduiront, on peut l’espérer, à un meilleur contrôle des maladies dues à cette espèce

Infection à Mycobacterium xenopi

Katalinic-Jankovic V, Popovic-Grle S, et al. Mycobacterium xenopi Pulmonary Maladie-épidémiologie et les caractéristiques cliniques chez les patients non immunodéprimés J Infect; : -Van Ingen J, MJ Boeree, de Lange WCM, et al Mycobacterium xenopi pertinence clinique et les déterminants, les Pays-Bas Emerg Infect Dis; : -M xenopi est un thermophile chromogène à croissance lente qui pousse de manière optimale à ° C Son nom d’espèce résulte de son isolement originel des lésions cutanées d’une grenouille griffée, Xenopus laevis M xenopi contamine les systèmes aquatiques, où il réside dans le biofilm et dans Contrairement aux États-Unis, où M xenopi est rarement isolé, cet organisme est la deuxième espèce de Mycobacterium non tuberculeuse la plus isolée isolée dans certains pays d’Europe. Andréjak et ses collègues ont examiné les données pour les patients le nord-est de la France qui répondait aux critères d’infection pulmonaire due à Xénopi au cours de la période -, en excluant un autre dont le résultat de culture positif était censé représenter une simple colonisation Les trois quarts étaient des comorbidités masculines présentes en% des personnes; La moitié avait une infection pulmonaire par le virus de l’immunodéficience humaine (VIH) ou une maladie néoplasique, et la moitié avait une maladie pulmonaire inactive. Une résistance in vitro à l’isoniazide, à la rifampine, à l’éthambutol et à la clarithromycine a été détectée en%,% et%. La co-infection par Aspergillus fumigatus était présente chez les patients et la co-infection par Pneumocystis jiroveci était présente dans les cavités, les nodules et les infiltrats ont été observés sur les radiographies thoraciques chez environ un tiers des patients. %; la durée médiane de survie était de mois En analyse multivariée, des prédicteurs indépendants significatifs ont été identifiés, avec une présentation avec des infiltrats pulmonaires associés à une survie réduite et un traitement avec un régime contenant de la rifampine associé à une amélioration de la survie. xénopi a été isolé au Laboratoire National de Référence des Mycobactéries de l’Institut National Croate de Santé Publique pendant la période considérée – Quatre-vingt-dix pour cent présentaient des comorbidités le plus souvent une maladie pulmonaire obstructive chronique, alors qu’aucun n’avait de maladie immunosuppressive systémique ou recevait un traitement immunosuppresseur. M xenopi ont été rencontrés en% des patients; les trois quarts avaient une maladie cavitaire Un patient de la lobectomie a subi une hémoptysie, alors que la chimiothérapie reçue, la plupart avec une combinaison d’isoniazide, de rifampine et d’éthambutol, a été notée en%, et une maladie stable a été notée dans le reste; aucun cas n’a progressé. Van Ingen et ses collègues ont passé en revue les données de tous les patients chez qui M xenopi a été isolé pendant la période – aux Pays-Bas et ont constaté que% répondaient aux critères d’infection; % étaient des hommes L’examen de la position dans la région hypervariable du gène S a permis la division de M xenopi en génotypes, et le génotype II était fortement associé au rapport de cotes d’infection active; % Intervalle de confiance, -; Les patients étaient infectés par le VIH. Deux patients avaient une infection pleurale, et un autre était infecté par le VIH. La spondylodiskite a été retrouvée chez un patient, Aspergillus flavus chez un patient et Scedosporium apio chez un patient. Le spermum a été récupéré chez la plupart des patients recevant – ou – des combinaisons médicamenteuses de médicaments antimycobactériens pendant une durée moyenne de quelques mois. Le traitement a été réalisé chez les patients%, alors que la positivité de la culture persistante est apparue en%; autres patients décédés Quatre patients répondant aux critères d’infection active n’ont pas été traités et ont été guéris, sont restés en culture positive et sont décédés Quatre patients traités ont présenté une rechute après plusieurs moisCes études ont montré que la grande majorité des cas de xénopi pulmonaire Chez les hommes, les comorbidités sont fréquentes et la comorbidité associée la plus fréquente est une maladie pulmonaire obstructive chronique. La mortalité associée est élevée, même avec un traitement. Chez les patients présentant des cavités pulmonaires, une co-infection avec des champignons filamenteux, le plus souvent Aspergillus, peut survenir. Les lignes directrices les plus récentes de l’American Thoracic Society-Infectious Diseases Society of America indiquent que le traitement de base devrait consister en une combinaison de clarithromycine, de rifampicine et d’éthambutol . « Un régime raisonnable pourrait consister en isoniazide, rifabutine ou la rifampicine, l’éthambutol et la clarithromycine, avec ou sans traitement initial de la streptomycine A quinolone, de préférence la méthoxy quinolone moxifloxacine, pourrait être substituée à l’un des médicaments antituberculeux « p La résection chirurgicale peut être indiquée dans certains cas